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雖然有機肥的成分種類較多，但是每種養(yǎng)分的含量相對較少，并且病菌較多。需要存放腐熟以殺滅病菌、并與化學肥料配合使用，效果更好。
隨著科學技術的不斷發(fā)展，通過有益菌群的人工篩選、分離、馴化培養(yǎng)技術，將有益菌群接入無害化處理后有機肥中，可以生產(chǎn)出多種多樣不同品種的生物有機肥，它能改善土質(zhì)、減少環(huán)境污染、增肥增效等。
有機農(nóng)業(yè)中使用的有機肥需經(jīng)過有機認證機構的認證，符合產(chǎn)品的生產(chǎn)標準。近些年來，我國各種生物肥料發(fā)展迅速，年產(chǎn)量達數(shù)十萬噸以上。這些生物肥料以科技含量較高、增產(chǎn)效果明顯和為主要特點，它的生產(chǎn)、推廣和應用對增進土壤肥力，提高農(nóng)作物產(chǎn)量，改善農(nóng)作物品質(zhì)和切實推行農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展都有積極意義。 針對生物肥料在生產(chǎn)、產(chǎn)品質(zhì)量和使用等方面存在的問題，本刊記者采訪了江西農(nóng)業(yè)大學高勇生教授，旨在提高農(nóng)村廣大群眾對這類肥料的認識，更加正確、科學地使用這些肥料，以促進我國生物肥料的健康發(fā)展。

生物有機肥是指特定功用微生物與主要以動植物殘體(如畜禽糞便、農(nóng)作物秸稈等)為來歷并經(jīng)無害化處理、腐熟的有機物料復合而成的一類兼具微生物肥料和有機肥效應的肥料。和化肥比較，生物有機肥營養(yǎng)元素完全，具有改善土壤、進步產(chǎn)品品質(zhì)、改善作物根際微生物群、進步植物的抗病蟲才能、進步化肥使用率等特色，深受農(nóng)喜歡?？墒?，在近年來生物有機肥出產(chǎn)經(jīng)銷和實踐使用中，卻呈現(xiàn)了一系列亟待解決的問題，詳細如下：

看有機肥料外觀顏色，物理方法干燥的有機肥料，仍保持原糞便的顏色，只是水分減少，通過堆肥技術處理的有機肥料腐熟后顏色變?yōu)楹稚蚝诤稚?，在成品中沒有其它雜質(zhì)。 二摸：用手抓一把有機肥料，其手感一致，濕時柔軟有彈性，干時很脆，容易破碎，劣質(zhì)有機肥料用手可以摸到雜質(zhì)，特別是沙子。 三水泡：拿兩杯清水，分別放入一些和低劣有機肥料，幾分鐘就可分辨出真?zhèn)巍Ｓ袡C肥料摻假一般是加入沙子或土來增加重量。有機肥料在水中分布均勻，而劣質(zhì)有機肥料的杯底沉入很多沙子或土，區(qū)別明顯。